北熊本駅は、熊本電鉄 菊池線と藤崎線の分岐駅です。
路線区分は、上熊本～北熊本～御代志が「菊池線」、北熊本～藤崎宮前が「藤崎線」となっていますが、運行実態は、藤崎宮前～北熊本～御代志と、上熊本～北熊本、となっています。構内配線は上熊本～北熊本～御代志でスルー出来るように見えますが、信号ルートでは全く独立しているようで、直通運転はできない模様です。
しかし構内がコンパクトであるため両線の接続を1～2分以内にでき、乗り換えは非常にスムーズに行われます。そして藤崎宮前行き列車と上熊本行き列車の同時出発も頻繁に見ることができます。

分岐の配線　　：事前型・並走型
構内配線の分類：線路別

※分岐駅の形態別分類 http://railscape.blue.coocan.jp/junction/junction-3.htm
　鉄路ノ景/分岐の景 http://railscape.blue.coocan.jp/junction/junction-2.htm
　鉄路ノ景 http://railscape.blue.coocan.jp/railscape_top.htm